1. 如果发现卧室正上方被改造成了楼上的卫生间，这通常是因为楼上业主未经过允许，私自对房屋结构进行了不当改动。

2. 根据我国的《住宅室内装饰装修管理办法》，禁止将未设置防水设施的房间或阳台改造为卫生间或厨房。因此，卧室上方的卫生间改动属于违规行为。

3. 面对这种情况，首先应当与楼上邻居进行沟通，了解卫生间改动的具体情况。在确认违规行为后，可以要求楼上邻居采取措施，比如对受影响的卧室进行隔音处理，以减少噪音和可能的潮湿问题。

4. 如果私下协商无法达成一致，可以向物业管理方寻求帮助。如果物业无法解决问题，可以直接向地方政府住房城乡建设部门投诉楼上业主的违规行为。

5. 相关部门在调查核实后，将对违规改动下达整改通知，并可能对业主进行罚款等行政处罚。这样，不仅可以纠正楼上业主的违规行为，还可以保护你的合法权益。